A gestão do IMB é realizada através dos Conselhos Diretor e Fiscal. O Conselho Diretor, que é um órgão colegiado, composto no mínimo de 03 (três) associados efetivos ou fundadores, responsáveis pela direção e administração do Instituto, subordinados à Assembleia Geral de associados, cabendo-lhe deliberar, controlar e orientar as ações desta associação. O Conselho Fiscal, por sua vez, é o órgão de fiscalização, assessoramento e deliberação da instituição.
Além dos dois Conselhos mencionados, o IMB possui ainda um Conselho Científico cuja responsabilidade é orientar as práticas científicas e avaliar propostas técnicas desenvolvidas pela instituição.
Conselho Diretor
Jonas Rodrigues Leite, PhD
Presidente
Maíra Borgonha, MSc
Secretária
Matheus Oliveira Freitas, PhD
Tesoureiro
Flávia Oliveira Moreira
Maurício Hostim-Silva, PhD
Conselho Fiscal
Bianca Bentes, PhD
Beatrice Padovani Ferreira, PhD
Eduardo Gomes Sanches, PhD
Conselho Científico
Associados
Flávia Oliveira Moreira Calderón
Jornalista